1950 yılında Bursa’da doğdu. İstanbul Ü. Tıp Fakültesinden 1973 yılında tıp doktoru olarak mezun oldu. 1975 yılında “hava tababeti temel kursunu” bitirerek uçuş doktoru unvanı aldı. 1977 yılında Gülhane Askeri Tıp Akademisinde başladığı uzmanlık eğitimini 1980 yılında tamamlayarak psikiyatri uzmanı oldu. 1980 yılında Eskişehir Hava Hastanesine tayin oldu. 1992 yılında erişkin psikiyatrisi dalında doçentliğe yükseldi. 1998 yılında Hava Kuvvetlerinden Albay rütbesiyle emekli oldu. 2000 yılında kurulan Havacılık Tıbbı Derneği’nin Başkanlığını halen de yürütmektedir. Ülkemizde konusundaki tek dergi olarak 2006 yılında yayınlanmaya başlayan Havacılık Tıbbı Bülteni’nin editörüdür. 2010 yılında kurulan Sivil Havacılık Akademisi’nde 3 yıl koordinatörlük görevi üstlendi. 2011-2014 yıllarında Anadolu Üniversitesi Havacılık ve Uzay Tıbbı Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü görevinde bulundu. Halen uzmanlık alanında hastalarına şifa dağıtmaya devam etmekte olan Prof.Dr. Muzaffer Çetingüç, alanına yönelik yazılarıyla yazın hayatında da özgün eserleriyle tanınmaktadır.